信息概要
全基因组测序(WGS)是一种覆盖个体全部基因组的高通量测序技术,遵循国际标准化组织(ISO)及相关行业规范,如ISO/IEC 17025:2017《检测和校准实验室能力的通用要求》。该标准于2017年发布,现行有效,暂无明确废止时间。检测内容涵盖基因组变异分析、功能注释、疾病关联研究等,适用于科研、临床诊断及健康管理领域。检测项目
全基因组测序覆盖度分析,单核苷酸多态性(SNP)检测,插入缺失(InDel)分析,拷贝数变异(CNV)鉴定,结构变异(SV)识别,线粒体基因组测序,表观遗传标记分析,病原微生物检测,药物代谢相关基因解读,遗传病致病突变筛查,肿瘤体细胞突变分析,杂合性缺失(LOH)评估,端粒长度测定,基因融合事件检测,转录调控区域注释,群体遗传学分析,进化树构建,功能基因富集分析,微生物组关联分析,基因表达定量预测。
检测范围
人类基因组DNA样本,动物基因组样本,植物基因组样本,微生物基因组样本,血液样本,唾液样本,组织切片样本,细胞培养样本,FFPE样本,环境宏基因组样本,古DNA样本,病毒基因组样本,肿瘤组织样本,胎儿游离DNA样本,法医物证样本,转基因生物样本,合成基因组样本,病原体耐药性监测样本,遗传病家系样本,健康人群筛查样本。
检测方法
Illumina NovaSeq 6000双端测序法(基于边合成边测序技术,读长150-300bp)。
PacBio SMRT单分子实时测序(长读长技术,适合复杂结构变异分析)。
Oxford Nanopore纳米孔测序(实时超长读长,直接检测表观修饰)。
PCR-free文库构建法(减少GC偏好性,提升均一性)。
杂交捕获富集技术(针对特定区域深度测序)。
全基因组扩增(WGA)法(适用于微量样本)。
10x Genomics单细胞测序(解析细胞异质性)。
CRISPR-Cas9靶向富集(高效捕获目标基因)。
甲基化特异性测序(bisulfite处理检测DNA甲基化)。
宏基因组组装(环境样本中混合基因组的拼接分析)。
ChIP-seq染色质免疫沉淀测序(转录因子结合位点鉴定)。
Hi-C染色体构象捕获(三维基因组结构解析)。
RNA-seq联合分析(验证基因表达与变异关联)。
机器学习驱动变异注释(整合多数据库进行功能预测)。
质谱验证法(针对关键突变位点的蛋白水平验证)。
检测仪器
Illumina NovaSeq 6000测序仪,PacBio Sequel IIe测序仪,Oxford Nanopore GridION,Thermo Fisher Ion GeneStudio S5,BGI MGISEQ-2000,Agilent 4200 TapeStation,Qiagen QIAcube核酸提取仪,Covaris M220超声破碎仪,Beckman Coulter Biomek液体处理工作站,Nanodrop分光光度计,Qubit荧光定量仪,Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪,Eppendorf离心机,ABI 3500遗传分析仪,Leica显微操作系统。