病原微生物高通量检测

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信息概要

病原微生物高通量检测基于《病原微生物检测高通量测序技术标准》（标准编号：T/CPMA 024-2023），该标准于2023年5月发布，目前尚未废止。其核心内容涵盖样本处理、测序流程、数据分析及结果解读的规范化要求，适用于临床、环境和食品等领域的微生物组快速筛查与精准鉴定。

检测项目

细菌16S rRNA基因测序，真菌ITS区域测序，病毒全基因组测序，耐药基因检测，毒力因子分析，微生物群落多样性评估，病原体绝对定量，宿主免疫反应关联分析，环境微生物污染溯源，食源性致病菌筛查，寄生虫DNA检测，抗生素耐药表型预测，微生物代谢通路注释，新发病原体发现，宏基因组组装分析，病原体进化树构建，微生物与疾病相关性研究，生物膜形成能力评估，微生物载量动态监测，病原体分型与溯源。

检测范围

临床血液样本，呼吸道样本，粪便样本，尿液样本，脑脊液样本，组织活检样本，环境水体样本，土壤样本，空气样本，食品表面样本，医疗器械表面样本，药品原料样本，化妆品原料样本，动物源性样本，植物病原体样本，工业发酵菌群样本，冷链运输样本，医院感染监测样本，污水处理样本，极端环境微生物样本。

检测方法

宏基因组测序（基于Illumina/Nanopore平台的全基因组无偏性检测），靶向扩增子测序（针对特定基因区域的高灵敏度检测），单细胞微生物测序（解析微生物异质性），实时荧光定量PCR（病原体快速定量），数字PCR（超低丰度病原体精准检测），代谢组学联用分析（微生物功能活性评估），CRISPR-Cas系统检测（特异性核酸片段识别），质谱技术（微生物蛋白标志物鉴定），流式细胞分选（微生物群体分离），荧光原位杂交（空间分布可视化），生物信息学机器学习模型（耐药性预测），纳米孔直接测序（实时病原体监测），微滴微流控技术（高通量单微生物分析），宿主转录组关联分析（感染免疫机制研究），噬菌体展示技术（病原体表面蛋白互作研究）。

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000测序仪，Oxford Nanopore GridION，Thermo Fisher QuantStudio实时荧光定量PCR仪，Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统，Agilent 2100生物分析仪，AB SCIEX TripleTOF质谱仪，BD FACSAria流式细胞仪，Oxford Nanopore PromethION，PacBio Sequel IIe，Qiagen QIAcube全自动核酸提取仪，Beckman Coulter Biomek自动化液体处理工作站，NanoString GeoMx空间基因组学系统，10x Genomics Chromium单细胞平台，Luminex MAGPIX多指标检测系统，Illumina MiSeq靶向测序仪。

注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。