细胞沉默核小体实验

(CMA)     (ISO) (高新技术企业)

信息概要

细胞沉默核小体实验是一种专注于分析核小体在基因沉默过程中的状态和修饰的表观遗传学检测方法。核小体作为染色质的基本结构单元，其修饰如组蛋白甲基化、乙酰化以及DNA甲基化等，直接调控基因表达和沉默机制。检测这些参数对于理解疾病发生机制、药物靶点发现、生物标志物鉴定以及基础科学研究至关重要。本检测服务由第三方专业机构提供，确保高精度、可靠性和重复性，为科研和临床应用提供全面支持。

检测项目

组蛋白H3K27me3修饰水平, 组蛋白H3K9me3修饰水平, 组蛋白H3K4me3修饰水平, 组蛋白H3乙酰化水平, 组蛋白H4乙酰化水平, DNA甲基化程度, 核小体占据率, 染色质可及性, 基因表达水平, 蛋白质-DNA结合强度, 核小体间距, 组蛋白变体含量, 染色质构象, DNA accessibility score, 甲基化特异性位点, ChIP-seq峰值, ATAC-seq峰值, RNA-seq FPKM, 核小体周转率, 组蛋白修饰酶活性, DNA去甲基化水平, 染色质重塑因子结合, 核小体相位, 基因沉默标志物表达, 表观遗传年龄, 甲基化敏感酶切效率, 核小体阵列分析, 染色质纤维长度, 单细胞核小体状态, 多组学数据整合

检测范围

人类HeLa细胞, 人类MCF-7细胞, 小鼠胚胎干细胞, 人类外周血单核细胞, 大鼠肝细胞, 人类脑组织, 小鼠肝组织, 人类癌症细胞系, 正常组织样本, 干细胞衍生细胞, 原代成纤维细胞, 免疫细胞如T细胞, 神经元细胞, 上皮细胞, 间充质干细胞, 肌肉细胞, 酵母细胞, 植物拟南芥细胞, 果蝇S2细胞, 斑马鱼胚胎细胞, 鸡胚细胞, 猪肾细胞, 猴肾细胞, 人类诱导多能干细胞, 疾病模型如阿尔茨海默病细胞, 转基因小鼠细胞, 敲除细胞系, 过表达细胞系, 临床样本如肿瘤组织, 体液样本如血液

检测方法

染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）：通过抗体富集特定蛋白质结合的DNA区域，并进行高通量测序以分析蛋白质-DNA相互作用。

assay for transposase-accessible chromatin with sequencing（ATAC-seq）：使用转座酶插入测序适配器来检测开放染色质区域，评估染色质可及性。

微球菌核酸酶测序（MNase-seq）：利用MN酶消化未保护的DNA，分析核小体位置和占据率。

亚硫酸氢盐测序（Bisulfite sequencing）：将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，通过测序检测DNA甲基化状态。

定量PCR（qPCR）：实时监测DNA扩增过程，用于定量特定基因或序列的表达水平。

流式细胞术（Flow cytometry）：测量细胞物理和化学特性，用于细胞分选和分析表面标志物。

蛋白质印迹（Western blot）：通过电泳和抗体检测特定蛋白质的表达和修饰状态。

免疫荧光（Immunofluorescence）：使用抗体和荧光标记可视化蛋白质在细胞内的定位和分布。

质谱分析（Mass spectrometry）：鉴定和定量蛋白质及其修饰，如组蛋白修饰的化学组成。

Hi-C技术：捕获染色质三维构象，研究基因组 architecture 和远程相互作用。

DNaseI 超敏感位点测序（DNase-seq）：通过DNaseI酶切鉴定染色质可及性区域。

甲基化特异性PCR（MSP）：快速检测特定基因位点的甲基化状态，用于表观遗传筛查。

RNA测序（RNA-seq）：全面分析转录组表达水平，评估基因沉默相关RNA变化。

单细胞测序（Single-cell sequencing）：在单细胞水平分析基因组、转录组或表观组，揭示细胞异质性。

染色质构象捕获（3C）：研究特定基因座之间的染色质相互作用，评估三维结构影响。

检测仪器

Illumina NovaSeq测序仪, 实时定量PCR系统如ABI 7500, 流式细胞仪如BD FACSVerse, 质谱仪如Thermo Orbitrap, 共聚焦显微镜, 超速离心机, 凝胶电泳系统, Nanodrop分光光度计, Qubit荧光计, 细胞培养箱, 液氮罐, 高效液相色谱仪, 气相色谱质谱联用仪, 原子力显微镜, 微孔板阅读器

注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。