噬菌体基因组测序检测

(CMA)     (ISO) (高新技术企业)

信息概要

噬菌体基因组测序检测是一种先进的生物技术服务，通过高通量测序手段对噬菌体的全基因组进行解析，以获取其DNA序列信息。该检测有助于研究噬菌体的多样性、功能基因、进化关系以及潜在应用，如抗菌治疗、生物防治和工业酶开发。检测的重要性在于能够识别新型噬菌体、评估其宿主特异性、检测毒力因子和抗生素抗性基因，从而为公共卫生、农业和医学领域提供科学依据，推动噬菌体疗法的发展和应用。

检测项目

基因组大小,GC含量,编码序列预测,tRNA基因识别,rRNA基因识别,重复序列分析,噬菌体分类,宿主范围预测,毒力因子识别,抗生素抗性基因检测,噬菌体生命周期预测,基因组组装质量,序列比对,变异检测,系统发育分析,功能注释,代谢途径预测,噬菌体整合位点识别,启动子预测,终止子预测,基因表达水平预测,噬菌体颗粒形态,感染性测定,噬菌体滴度,DNA提取质量,文库构建质量,测序深度,覆盖度,错误率,污染检测,基因组完整性,噬菌体特异性标记,噬菌体进化分析,基因簇识别,噬菌体受体结合蛋白分析,噬菌体裂解酶检测,噬菌体免疫机制分析,噬菌体复制起点识别,噬菌体转录单元预测

检测范围

Myoviridae,Siphoviridae,Podoviridae,Tectiviridae,Corticoviridae,Lipothrixviridae,Rudiviridae,Fuselloviridae,Globuloviridae,Guttaviridae,Bicaudaviridae,Ampullaviridae,Clavaviridae,Plasmaviridae,Inoviridae,Microviridae,Leviviridae,Cystoviridae,Salterprovirus,Thermus噬菌体,大肠杆菌噬菌体,葡萄球菌噬菌体,链球菌噬菌体,假单胞菌噬菌体,芽孢杆菌噬菌体,乳酸菌噬菌体,弧菌噬菌体,沙门氏菌噬菌体,志贺氏菌噬菌体,耶尔森菌噬菌体,克雷伯菌噬菌体,肠球菌噬菌体,分枝杆菌噬菌体,蓝细菌噬菌体,古菌噬菌体,海洋噬菌体,土壤噬菌体,人体肠道噬菌体,动物源性噬菌体,植物病原噬菌体,工业用噬菌体,环境噬菌体,临床分离噬菌体,实验室保存噬菌体,野生型噬菌体,工程化噬菌体,温和噬菌体,烈性噬菌体,原型噬菌体,多样性噬菌体库

检测方法

全基因组测序：使用高通量测序技术获取噬菌体全基因组序列，以进行详细分析。

鸟枪法测序：将DNA随机片段化后测序并组装，适用于未知基因组的快速解析。

Illumina测序：基于边合成边测序的技术，提供高准确度的短读长数据。

PacBio测序：利用长读长测序技术，改善基因组组装和重复区域分析。

Oxford Nanopore测序：通过纳米孔实时测序，支持长读长和直接DNA检测。

PCR扩增：用于特定基因区域的靶向扩增，以验证或补充测序数据。

DNA提取：从噬菌体颗粒中纯化DNA，确保样本质量用于后续测序。

文库构建：制备测序文库，包括片段化、末端修复和适配体连接步骤。

生物信息学分析：使用软件工具进行序列组装、注释和功能预测。

BLAST比对：与公共数据库进行序列比对，以识别同源基因和分类信息。

基因预测：预测编码序列和开放阅读框，用于功能基因组学研究。

系统发育树构建：分析噬菌体进化关系，基于序列相似性构建树状图。

功能注释：赋予基因功能信息，如酶活性、结构域和通路参与。

变异calling：检测单核苷酸多态性和插入缺失，评估基因组变异。

质控分析：评估测序数据质量，包括读长分布、错误率和覆盖均匀性。

检测仪器

Illumina NovaSeq,PacBio Sequel,Oxford Nanopore MinION,PCR仪,电泳仪,离心机,分光光度计,生物分析仪,测序文库制备系统,计算机集群,服务器,存储系统,生物信息学软件,DNA测序仪,显微镜,恒温培养箱,超低温冰箱,核酸提取仪,凝胶成像系统,实时荧光定量PCR仪,酶标仪,超净工作台,高压灭菌器,微量分光光度计,核酸浓度测定仪,序列分析工作站,数据存储服务器,生物安全柜,样品处理机器人,测序反应板,荧光显微镜,DNA合成仪,蛋白质分析仪,细胞培养箱,噬菌体培养系统

注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。