信息概要
转录组测序检测基于《RNA测序技术规范》（GB/T XXXXX-XXXX），该标准于2020年发布，现行有效版本为2023年修订版，暂无明确废止时间。本标准涵盖样本制备、文库构建、测序分析及数据质控全流程，适用于真核生物与部分原核生物的转录组研究，重点规范了基因表达定量、可变剪切检测及差异分析的核心技术要求。
检测项目
差异基因表达分析, 可变剪切事件检测, 融合基因鉴定, 新转录本预测, 基因结构注释优化, lncRNA筛选与功能分析, circRNA定量与验证, miRNA-mRNA互作网络, 转录因子调控网络构建, 共表达模块分析, 基因集富集分析, 样本聚类与批次效应校正, RNA编辑位点识别, 异构体表达定量, 基因表达聚类热图, 样本间相关性分析, 表达量标准化处理, 转录组组装质量评估, 外源污染筛查, 低丰度基因检测
检测范围
人类全血样本, 动物组织样本, 植物叶片样本, 微生物纯培养物, 肿瘤细胞系, 原代培养细胞, 石蜡包埋组织, 单细胞悬液, 外泌体RNA, 粪便宏转录组, 土壤环境样本, 海洋生物样本, 昆虫表皮组织, 古生物化石提取物, 转基因生物样本, 病毒感染的宿主细胞, 临床穿刺样本, 植物种子胚乳, 极端环境微生物, 模式生物胚胎发育阶段样本
检测方法
polyA尾富集法（真核mRNA特异性捕获）
rRNA去除法（原核及低质量样本处理）
SMART-seq2（单细胞全长转录本扩增）
链特异性建库（保留转录本方向信息）
UMI标记定量（消除PCR扩增偏差）
DNase I消化（消除基因组DNA污染）
RIN值测定（RNA完整性评估）
Spike-in校准（跨样本定量标准化）
ISO-seq（全长转录本测序）
DGE-seq（数字化基因表达谱分析）
CLIP-seq（RNA-蛋白互作研究）
Ribo-seq（翻译组核糖体印记分析）
Nanopore直接RNA测序（避免反转录偏好性）
CAGE技术（启动子区域精准捕获）
scRNA-seq（单细胞转录组聚类分析）
检测仪器
Illumina NovaSeq 6000, PacBio Sequel IIe, Oxford Nanopore PromethION, Agilent 4200 TapeStation, Qubit 4.0 Fluorometer, Covaris M220超声破碎仪, Bioanalyzer 2100, QuantStudio 7 Pro实时定量系统, 10X Genomics Chromium控制器, Beckman Coulter Biomek i7, Covaris S220聚焦超声仪, NanoDrop One超微量分光光度计, MiSeq FGx小型测序仪, Fragment Analyzer系统, LightCycler 480 II PCR仪
