13C代谢示踪与转录组联合分析检测

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信息概要

13C代谢示踪与转录组联合分析检测是一种整合了稳定同位素标记技术和基因组学方法的高通量检测服务，主要用于研究细胞或生物体内的代谢通路动态变化及其基因调控机制。该检测通过使用13C标记的底物追踪代谢物流动，并结合转录组测序分析基因表达水平，从而揭示代谢网络与转录调控之间的相互作用。检测的重要性在于它能够提供全面的生物学洞察，帮助科研人员在疾病机理、药物开发、代谢工程等领域进行精准分析，例如在癌症代谢重编程、微生物发酵优化等应用中至关重要。概括来说，该检测服务信息覆盖了从样品处理到数据分析的全流程，确保结果的准确性和可靠性。

检测项目

13C标记效率评估,代谢物通量分析,基因表达水平定量,代谢通路富集分析,同位素异构体分布,转录本丰度测定,代谢物浓度测量,路径通量建模,基因集富集分析,代谢网络重构,差异表达基因识别,稳定同位素追踪效率,代谢物标记模式分析,转录因子调控网络,代谢物动态变化监测,基因功能注释,同位素稀释校正,转录组数据标准化,代谢物鉴定验证,通路活性评估

检测范围

癌细胞系,微生物培养物,植物组织,动物模型,血液样本,组织切片,发酵液,细胞培养基,尿液样本,粪便样本,生物体液,环境样本,食品样本,药物处理样本,基因编辑样本,病理样本,转基因生物,临床样本,工业发酵产物,农业产品

检测方法

稳定同位素标记法：通过引入13C标记的底物追踪代谢物在生物体内的流动路径。

转录组测序法：利用高通量测序技术分析全基因组的转录本表达水平。

代谢物提取与纯化法：采用色谱或质谱技术从样本中分离和纯化目标代谢物。

数据整合分析法：将13C示踪数据与转录组数据进行联合统计和生物信息学分析。

同位素比率质谱法：测量样本中13C/12C的比例以评估标记效率和代谢通量。

RNA提取与质检法：使用标准化流程提取RNA并确保其质量和完整性。

代谢通量建模法：基于示踪数据构建数学模型预测代谢网络中的通量分布。

基因表达定量法：通过qPCR或RNA-seq技术精确量化基因表达量。

通路富集分析法：应用统计学方法识别在特定条件下显著富集的代谢或信号通路。

多维数据可视化法：使用软件工具将联合分析结果以图形方式展示便于解读。

样本前处理法：对生物样本进行标准化处理以确保检测的一致性和可重复性。

质量控制法：在检测各阶段实施质量控制措施监控数据可靠性。

生物信息学注释法：对转录组数据进行基因功能注释和分类。

动态监测法：在时间序列上连续采集样本以分析代谢和转录的动态变化。

统计分析差异法：使用假设检验方法识别组间在代谢和基因表达上的显著差异。

检测仪器

液相色谱-质谱联用仪,气相色谱-质谱联用仪,核磁共振谱仪,高通量测序仪,实时荧光定量PCR仪,紫外-可见分光光度计,离心机,显微镜,酶标仪,电泳系统,样品制备工作站,数据采集软件,生物信息分析平台,同位素比率质谱仪,样本存储冰箱

问：13C代谢示踪与转录组联合分析检测主要应用于哪些研究领域？答：该检测广泛应用于癌症研究、代谢疾病机制探索、微生物代谢工程、药物毒理学评估以及农业生物技术等领域，帮助揭示生物过程的分子基础。

问：进行13C代谢示踪与转录组联合分析检测时，样本准备有哪些关键注意事项？答：关键注意事项包括确保样本新鲜度或适当保存（如液氮冷冻）、避免RNA降解、精确控制13C标记底物的浓度和处理时间，以及遵循无菌操作以防止污染。

问：13C代谢示踪与转录组联合分析检测的结果如何帮助优化工业发酵过程？答：通过分析代谢通量和基因表达变化，该检测可以识别发酵过程中的瓶颈基因或代谢路径，从而指导菌株改造或工艺优化，提高产物产量和效率。

注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。